При выполнении

cp -rdfp /some/source/path/* /some/dest/path

все файлы из /some/source/path, вроде как, должны скопироваться в /some/dest/path, однако этого не происходит и файлы, начинающиеся с точки (.htaccess, .bashrc и т.д.) не копируются.
Дело в том, что в bash существует ограничение при использовании шаблонов (wildcards) - по умолчанию символ * не включает в себя скрытые файлы (файлы начинающиеся с точки или dotfiles).

Чтобы скопировать (а также переместить командой mv или удалить командой rm) такие файлы, нужно сначала командой shopt включить опцию dotglob

shopt -s dotglob
cp -rdfp /some/source/path/* /some/dest/path

shopt без параметров покажет состояние всех опций оболочки
-s "включение" опции (от set)
-u "выключение" опции (от unset)